清洗肠道主要用洗肠的一些药物，最常用的是聚乙二醇类药物。聚乙二醇类药物通过口服以后再大量的喝水，能够起到清洗肠道的作用，能够让大便排出去。在肠镜检查之前，一般都是用这类药物清理肠道，效果比较好、安全性也比较好、费用不太高。所以是比较理想的清洗肠道的药物。
除聚乙二醇清洗肠道外，硫酸镁、甘露醇，磷酸钠盐等药物也可以清洗肠道，但是都没有聚乙二醇常用。这些药物各有各的特点，有的费用比较低、有的用量比较少。但是同样也有一些缺点，可能偶尔会有出现安全性的问题。例如喝甘露醇清肠时不能做肠道手术，所以用的不是特别多。如果确实因为某些原因不能用聚乙二醇，或者没有聚乙二醇，可以咨询医生，能不能利用其他的药物进行代替，包括中药番泻叶也能起到一定的清肠作用，能够替代聚乙二醇进行清肠。